По данным на 1 января 2012 года в Государственном племенном регистре России числится 49 племенных хозяйств, действующих на территории Бурятии.

Из них - три племенных завода, 20 племрепродукторов по разведению крупного рогатого скота мясного направления, 10 - по разведению КРС молочного направления. 3 племенных завода, 4 племенных репродуктора занимаются овцеводством. В коневодстве занято 6 племрепродукторов и одно генофондовое хозяйство в СПК «Витимский» Баунтовского района. Работает также один племенной завод по разведению свиней ЗАО «Свиноводческий комплекс «Николаевский» Тарбагатайского района и один репродуктор по разведению яков ООО  «Нэгэдэл» Окинского района.
Деятельность племенных заводов направлена на разведение и улучшение породных качеств животных, племенные репродукторы осуществляют разведение животных для обеспечения потребностей сельскохозяйственных товаропроизводителей.
В 2011 году поголовье скота племенных хозяйств насчитывало более 112 тыс. голов, что составляет 38 процентов от общего поголовья. Среднесуточный привес молодняка КРС в племхозяйствах - 650 гр. в сутки. Средний показатель выхода молодняка на 100 маток составил 76 голов КРС мясного направления, 84 - молочного,  66 - овец. 
Для улучшения племенной работы хозяйствами республики в 2011 году реализовано около 800 голов всех видов животных, приобретено по договорам лизинга более 8 тыс. голов крупного и мелкого рогатого скота.
В рамках республиканской целевой программы «Развитие агропромышленного комплекса и сельских территорий в Республике Бурятия на 2011-2017 годы и на период до 2020 года» сельхозтоваропроизводителям, осуществляющим деятельность в области племенного животноводства  предоставляются субсидии на содержание маточного поголовья. В 2011 году из двух уровней бюджета на эти цели выделено 90,3 млн. рублей. В текущем году объем запланированных финансовых средств увеличен и составляет 92,4 млн. рублей.